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| 海岸带生态保护与修复联合研究中心 | |
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2021年10月，实验室与华东师范大学崇明生态研究院达成合作意向，双方本着“平等合作、优势互补、共同发展”的原则，共建“海岸带生态保护与修复联合研究中心”，在海岸带生态保护与修复领域开展合作，为“十四五”我国海岸带重点生态系统保护和修复重点工程规划、蓝色港湾建设等提供技术支撑。 |
| 滨海电厂海洋生态联合研究中心 | |
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2021年10月，实验室与福建宁德核电有限公司签订了“滨海电厂海洋生态联合研究中心共建合作框架协议”，本着“平等自愿、互利互惠、共同促进、合作共赢”的原则，在滨海电厂冷源安全、海洋生态保护、海洋灾害监测预警等方面开展合作，共同研究、解决、应对滨海电厂相关的海洋生态现实及潜在问题。 |
| 海洋工程生态安全联合研究中心 | |
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2024年10月，与自然资源部厦门海洋中心、厦门路桥工程投资发展有限公司、中交第三航务工程局有限公司厦门分公司联合成立该中心，以海洋工程生态安全预警监测为主要研究方向，致力开展海洋工程生态监测、生态损害评估相关技术体系、海洋灾害预警保障服务、信息管理与共享体系等内容的探索研究和技术转化应用。 |